La especialidad de Acuicultura tiene sus inicios, junto con el Instituto del Mar desde el año 1988, período que coincide con el crecimiento y consolidación de la actividad acuícola en la región. Contempla la obtención del título Técnico de Nivel Medio en Acuicultura.

La preparación de los estudiantes se orienta al desarrollo de capacidades que permitan el desempeño laboral en el área de cultivo de peces, moluscos y algas. 

El objetivo de la especialidad es egresar técnicos profesionales capaces de desarrollar cultivos hidrobiológicos, comprender la dinámica de las poblaciones y su interacción con el ecosistema acuático, ser conscientes de las necesidades de los seres vivos y el procesamiento seguro y de calidad para los consumidores. 

También es importante señalar que la especialidad funciona bajo la modalidad dual, que consiste en que los alumnos alternan los espacios de aprendizaje en la empresa y en el liceo. 

Los centros de práctica, generalmente, son: centros de cultivo de salmones, tanto de agua dulce como de engorda en el mar, centro de cultivos de moluscos, laboratorios de servicios acuícolas, plantas de proceso de materias.